https://ojs.amiklps.ac.id/index.php/home <p class="p1">Jurnal Manajemen Informatika, Sistem Informasi dan Teknologi Komputer (JUMISTIK) di terbitkan oleh Kampus STMIK Amika Soppeng. JUMISTIK terbit 2 edisi per tahun pada bulan Juni dan bulan Desember dengan scope ilmu komputer yang mencakup manajemen informatika, sistem informasi dan teknologi komputer.</p> en-US admin@amiklps.ac.id (Zul Rachmat) wahyu@amiklps.ac.id (Wahyuddin S) Wed, 16 Sep 2026 02:52:06 +0000 OJS 3.3.0.3 http://blogs.law.harvard.edu/tech/rss 60 https://ojs.amiklps.ac.id/index.php/home/article/view/371 <p>Karsinoma nasofaring (NPC) merupakan keganasan epitelial yang memiliki prevalensi tinggi di Indonesia. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan analisis bioinformatika transkriptomik secara menyeluruh dan merekonstruksi jaringan interaksi protein-protein (PPI) pada pasien NPC Indonesia. Data sekuens RNA utuh (RNA-seq) dari 7 sampel biopsi pasien NPC dan 2 kontrol sehat diproses menggunakan pipeline komputasional HISAT2 v2.1.0 untuk alignment genome dan HTSeq v0.11.1 untuk kuantifikasi transkrip. Analisis ekspresi gen diferensial (DEG) mengeksekusi algoritma statistik edgeR v3.28.0 (TMM normalization, FDR &lt; 0,05, log2 FC &gt; 1), menghasilkan 2.043 gen ter-upregulasi dan 156 gen ter-downregulasi signifikan. Eliminasi komputasional mendeteksi bahwa 5 dari top 10 gen upregulated merupakan long non-coding RNA (lncRNA). Rekonstruksi grafik jaringan PPI menggunakan algoritma STRING v12.0 mengidentifikasi dua sub-kluster upregulated utama (SOX11–SALL3 dan GABRG2–KCNQ2) serta central hub node downregulated SERPINB3 yang terhubung dengan ALDH3A1, MSMB, dan SERPINB11. Hasil ini menegaskan efektivitas pipeline bioinformatika dalam mengekstraksi biomarker molekuler NPC.</p> Dicka Wahyu Setiasari, Fandisya Rahman Copyright (c) 2026 Jurnal Manajemen Informatika, Sistem Informasi dan Teknologi Komputer (JUMISTIK) https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 https://ojs.amiklps.ac.id/index.php/home/article/view/371 Wed, 16 Sep 2026 00:00:00 +0000